Finanssialan Keskusliiton toimistossa työskentelee 75 finanssialan osaajaa. Alla on kuvattu toimiston organisaatiomalli. Toimielinorganisaatio on kuvattu erikseen alempana.

Onnistunut ja laadukas edunvalvonta on liiton ydintehtävä, jossa laaja toimielinverkosto on keskeisessä roolissa.
 
Finanssialan Keskusliiton hallituksen alaisia johtokuntia on seitsemän. Johtokunnilla on päätösvalta toimialuettaan koskevissa asioissa, joilla ei ole vaikutusta koko FK:n tai muiden sektorikohtaisten johtokuntien työhön. 
 
Jäsenyhteisöjen edustajista koostuvien toimielinten keskeisin tehtävä on finanssialan kannan muodostaminen vireillä oleviin edunvalvontakysymyksiin. Edunvalvonta-asioiden lisäksi toimielinten vastuulla on muiden määriteltyjen yhteisten asioiden hoito.

Toinen keskeinen merkitys on siinä, että toimielimet ovat tehokas tapa kerätä tietoa ja kuulla jäsenyhteisöjen näkemyksiä sellaisista asioista, joissa liiton tulee olla aktiivinen muun yhteiskunnan suuntaan. Näitä ovat esimerkiksi toiveet lainsäädännön tai viranomaisten käytännön muuttamiseksi.  

Finanssialan Keskusliiton hallitus on asettanut seuraavat johtokunnat ja niiden puheenjohtajat:

Hallitus nimeää 7 toimikuntaa ja johtokuntien alaisuudessa toimii 21 toimikuntaa. Näiden toimikuntien alaisuudessa toimii yhteensä 8 jaostoa.

Finanssialan Keskusliiton hallitus on nimennyt seuraavat toimikunnat:
Arvopaperitoimikunta

Verotoimikunta 
​Viestintätoimikunta